Заклад засновано Рішенням виконкому Харківської міської Ради депутатів трудящих №586 від 30.09.1960 року. Відповідно до розпорядження фонду міського майна №321 від 31.03.1993 р. засновано середня загальноосвітня авторська школа №65.
Відповідно до розпорядження фонду комунального майна №43 від 19.01.1998 р засновано комунальний заклад освіти середню загальноосвітню школу І-ІІІ ступенів №65 „Авторську школу професора Тарасова Л.В.” „Екологія та діалектика”.
З 2005 року заклад перейменовано у Харківську гімназію № 65 Харківської міської ради Харківської області.
З 1960 по 1982 рік директором закладу був Ткачук Іван Тимофійович.
З 1982 по 2002 рік директором закладу була Дем'янова Валентина Вікторівна, яка пройшла свій шлях від посади вожатої до директора школи.
З 2003 року до лютого 2011 року заклад очолювала Волобуєва Галина Миколаївна. З березня 2011 року диретором призначено Ткаченко Лідію Анатоліївну
Педагогічний колектив.
Всього вчителів - 56 , з них:
- вчителів вищої категорії – 20
- мають звання «старший вчитель» - 7
- мають звання «Вчитель – методист» - 8
- мають звання «Заслужений вчитель України» - 0
- мають звання «Відмінник освіти» - 3
Спеціалізоване навчання:
- 3 вчителя отримали освіту в інституті післядипломної освіти при Харківському державному педагогічному університеті ім. Г.С.Сковороди за фахом «Менеджер освіти»
Профільне навчання в гімназії:
2 напрями навчання:
- природничо - математичний напрям ( природничий профіль);
- суспільно – гуманітарний напрям ( правовий профіль)
Пріоритетні напрями роботи гімназії:
Участь у Всеукраїнському експерименті по впровадженню інноваційної технології в освітній процес – науково – педагогічного проекту «Росток»
Співробітництво з ВНЗ:
- Харківський державний педагогічний університет ім. Г.С.Сковороди;
- Національний технічний університет "Харківський політехнічний інститут"
- Харківський педагогічний коледж
- Інститут інновацій і змісту освіти при Міністерстві освіти і науки України, м. Київ
Гурткова робота:
У гімназії працюють 8 гуртків і секцій:
- стрілецький гурток;
- гурток бального танцю;
- театральний;
- гурток технічного моделювання;
- гурток «Народний умілець»;
- туристичний гурток;
- секція волейболу;
- секція художньої гімнастики.